Encuesta de Prescribe Ciencia
Publicado el 3-Diciembre-2008
Las directoras de Prescribe Ciencia, Ana Creamdes y Amparo Sebastián nos invitan a participar en una breve encuesta on-line. Nuestra opinión ayudará a realizar el estudio de viabilidad de distintas iniciativas transversales que mejoren y profesionalicen la labor de los mediadores de la Cultura Científica. La encuesta se realiza de forma totalmente anónima en uno o dos minutos a través del enlace:
Muchas gracias por vuestra colaboración
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Individuos vs. Instituciones
Publicado el 28-Noviembre-2008
De esto hablé en la mesa de La Ciencia en Internet
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Los individuos tienen unas características más propicias que las Instituciones para formar parte de Internet. Si no conseguimos cambiar las Instituciones habrá que trabajar con los individuos.
Aquí dejo una foto para el recuerdo
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La Ciencia en Internet- Jueves 27-N
Publicado el 21-Noviembre-2008
Estaré en muy buena compañía el próximo jueves 27. Lee y difunde por favor.
El próximo jueves 27 de noviembre a las 19 h en la sede del Instituto Cervantes (C/ Barquillo, 4) tendrá lugar el encuentro “La Ciencia en Internet” en el que se analizará el presente y el futuro de la información científica en la Red.
Uno de los grandes retos a los que se enfrenta la divulgación de la ciencia es hacer llegar la cultura científica a sectores cada vez más amplios de la sociedad. Para alcanzar este objetivo, Internet es uno de los grandes aliados. Ante la escasa oferta de información sobre ciencia que se encuentra en los canales tradicionales, Internet se ha convertido en el medio en el que confluyen comunicadores de la ciencia, investigadores y público general.
En la Red surgen cada día nuevos proyectos que tratan de servir de punto de encuentro entre ciencia y sociedad. En este foro se analizarán algunos de ellos, así como el desarrollo futuro del campo de la comunicación científica en este mundo virtual.
También los investigadores encuentran en Internet una herramienta que multiplica de manera exponencial la rapidez en la transmisión del conocimiento. Sin embargo, muchos de ellos todavía muestran reservas a la hora de plasmar sus trabajos en la web. En esta jornada podremos saber por qué, además de conocer las ventajas e inconvenientes que conlleva el uso de la web.
Al encuentro acudirán Tíscar Lara, autora del blog tiscar.com y profesora en la Universidad Carlos III, como moderadora; Tomás de Miguel, director de RedIRIS; Víctor Domingo, presidente de la Asociación de Internautas; Pablo Jáuregui, redactor jefe de la sección de Ciencia en El Mundo; M. Luz Congosto, Asesora de Telefónica I+D y profesora de la Universidad Carlos III; y Juan Julián Merelo, director de la Oficina de Software Libre de la Universidad de Granada.
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IR 9.0.
Publicado el 23-Octubre-2008
La semana pasada estuve en Copenhague con en el IR 9.0. Tíscar presentó la ponencia que preparamos sobre el barriblog de periodistas. Coincidimos con los investigadores de la UOC Edgar, Adolfo, Elisenda y Paco.
A la vuelta el trabajo me he encontrado que los marrones que dejé me estaban esperando y que todo era aún más urgente. Por eso no he tenido tiempo de actualizar el blog, pero tanto Tíscar como Elisenda y Paco han estado más aplicados y han escrito sus impresiones:
- Rethinking community en Copenhague, AoIR por Tiscar
- Slow science por Elisenda
- Internet Research 9.0: Rethinking Community, Rethinking Space. Key speaker: Mimi Ito por Paco
Para mí ha sido mi primer congreso y lo estoy asimilando. Me ha asaltado la duda de:
¿Qué hace una chica cuantitativa como yo en un sitio cualitativo como este?
Mañana lo pensaré, como decía Escarlata O’Hara (no es muy científico pero sí es muy cinematográfico)
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Como usar TouchGraph Navigator y no morir en el intento
Publicado el 22-Septiembre-2008
Como comentaba en el post anterior llevo varias semanas lidiando con TouchGraph Navigator, la versión de pago de Google. Me ha recordado a los programas de Microsoft que son de pago, pero funcionan mal. Esta herramienta se ajusta al estilo minimalista de Google, por ese motivo los mensajes de error son tan transparentes que no se ven. Esta estética no favorece nada a la depuración y hace perder mucho tiempo.
Para poder mostrar que la visualización no es algo complejo se utilizará el mismo método de explicación que en las herramientas GraphViz y Pajek. mediante un procedimiento en tres pasos:
Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.
Transformar datos a formato .xml: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato xml.
Generar el gráfico: Se procesa el fichero .xml con el programa TouchGraph Navigator
El resultado obtenido con TouchGraph se puede observar en estas tres imágenes estáticas. Corresponde a la agrupación de los blogs que han participado en el meme de Enjut@ Mojamut@ según: género, fecha de la participación y grado de influencia en la propagación. No ha sido posible publicar los resultados de una forma interactiva por razones que se explican más adelante.
Al pulsar en las imágenes aparecerán en su tamaño real.
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Agrupación por género: En el halo rosa se encuentran los blogs femeninos y en azul los masculinos |
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Agrupación en torno a la fecha de propagación: Los blogs aparecen agrupados por su coincidencia temporal en la propagación del meme. |
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Agrupación en relación en la influencia en la propagación del meme: Se han clasificado los blogs en cinco TIERs según el número total de memes de los que son origen, directa o indirectamente: TIER-5 50 o más de 50, TIER-4 entre 49 y 25, TIER-3 entre 24 y 10, TIER-2 entre 9 y 5, TIER-1 entre 4 y 1 y TIER 0 los que no ha propagado el meme. |
Entorno de ejecución:
| Local | Es necesario bajarse el awk para Windows, tener instalada la maquina java y descargarse TouchGraph Navigator |
| Servidor | No apto para una doctoranda sin recursos. |
TouchGraph Navigator aporta las siguientes mejoras sobre la versión liberada:
- Permite capturar los datos desde una hoja de cálculo Excel además de la opción del fichero XML. Esto facilita la captura de datos desde herramientas ofimáticas y no precisa una transformación de los datos a un formato XML.
- Amplía las posibilidades de visualización y mejora la estética.
Cuando empecé a utilizar la herramienta me pareció sencilla hasta que intenté visualizar “El meme de enjut@ Mojamut@”. Me llevó una semana descubrir que el tamaño si importa. Para que me funcionara tuve que acortar el número de nodos a 135 (elegí los blogs con una fecha más temprana de publicación del meme). Además, la interfaz Excel producía resultados erróneos aunque afortunadamente la entrada de datos por xml mostró mejor comportamiento.
El segundo tropiezo fue cuando intenté publicar en la web los resultados. Me devolvía el error de que no tenía licencia y me invitaba a pasar por caja. Por este motivo los resultados mostrados de la evaluación de la herramienta son estáticos en vez de dinámicos, como a mi me habría gustado. Por supuesto en la página de descarga de la versión de evaluación no se indicaba las limitaciones de la herramienta en cuanto al tamaño del grafo ni las condiciones para la publicación de los resultados en la Web. Solo me queda pedir una licencia como betatester a los de TouchGraph Navigator para poner a prueba su sensibilidad con los tesistas.
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Visualizando con TouchGraph free
Publicado el 9-Septiembre-2008
Este post se lo dedico a Loretahur, a la que admiro en sus múltiples facetas y que en un plis-plas me ha solucionado el problema de alojamiento de la visualización en TouchGraph. Muchas gracias Lorena.
TouchGraph es un programa escrito en java que permite visualizar y navegar interactivamente por redes de información interrelacionada. Existen dos modalidades, una versión liberada en sourceforge y una versión de pago propiedad de Google. He querido probar ambas versiones antes de publicar este post.
Aunque en la versión liberada la documentación es escasa, no me costó mucho hacerla funcionar. Sin embargo, TouchGraph Navigator, la versión de pago, ha resultado ser muy cansina. Durante dos semanas he intentado hacer que visualizase la propagación de El meme de Enjut@ Mojamut@ con resultados desconcertantes. Al final he llegado a la conclusión de que está limitado el numero de nodos de la red, no sé si en la versión de evaluación que me descargado o si el problema también existe en la versión de pago. Al menos he acotado el problema y he podido ver como funciona.
Por razones de extensión en este post se explicará como visualizar con la versión liberada de TouchGraph y dejaré para un segunda parte cómo usar TouchGraph Navigator y no morir en el intento.
Pulsando en la siguiente figura se accederá a la visualización de la propagación del meme de Enjut@ Mojamut@. Pido disculpas, pero solo funciona en Firefox.
Ayuda a la navegación:
Situación inicial:
- Aparecen todos los nombres de los blogs agrupados. Situar el ratón encina de los nombres hasta que aparezca la palabra inicio.
- Pulsar con el botón derecho del ratón y en el menú asociado seleccionar “Expand node”
- Se desplegará la visualización.
Navegación:
- Barra superior: Controla el zoom. Hacia la derecha aumenta y hacia la izquierda disminuye
- Barra inferior: Controla el scroll
- Cursor sobre el nodo: Aparece información sobre el blog
- Botón derecho del ratón: Permite, expandir, comprimir o seleccionar el nodo
- Botón izquierdo del ratón: Enlaza al blog seleccionado en ese momento.
Información de los nodos:
- Color: Los nodos morados son de blogueras y los rojos son de Blogueros
- Formas: El rectángulo con esquinas redondeadas representa a los blogs que han propagado el meme y el rectángulo a los blogs que no lo han propagado.
- Tamaño de letra: Las letras de tamaño grande corresponden a los blogs que han propagado indirectamente más de 10 memes, las letras más pequeñas a los que no han propagado ningún meme y las letras de tamaño mediano al resto.
- Número asociado: indica que el nodo está comprimido y que se puede expandir en n conexiones
¿Cómo lo he hecho?
Como ya es costumbre, para poder mostrar que la visualización no es algo complejo se utilizará el mismo método de explicación que en las herramientas GraphViz y Pajek. mediante un procedimiento en tres pasos:
Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.
Transformar datos a formato .xml: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato xml.
Generar el gráfico: Se procesa el fichero .xml con el programa TouchGraph
- Filtro awk: memes_precedencias_touchgraph.awk
- fichero xml generado: precedencias.xml
- Comando para generar el fichero .xml
Entorno de ejecución local:
- Es necesario bajarse el awk para Windows, tener instalada la maquina java y descargarse Touchgraph libeado.
Entorno de ejecución en servidor con java:
- Subir a un directorio: BrowserLauncher.jar, nanoxml-2.1.1.jar, TGGraphLayout.jar, TGLinkBrowser.jar, el fichero html para lanzar la visualización y el fichero xml.
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Encontrándome a mi misma
Publicado el 29-Agosto-2008
Esta semana me encontré a mi misma. Buscando en Internet aterricé en el simposio de Visualizar que organizó Medilab Prado en noviembre de 2007. Allí estaba el programa del simposio y en la parte de comunicaciones, mi nombre seguido de un enlace a +info. Al pinchar me encontré a mi misma hablando de BarriBlog:
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Matriz geodésica con Pajek
Publicado el 21-Agosto-2008
Como comentaba en el post anterior, Pajek es más que un visualizador de grafos, es un programa de análisis de redes que nos permite descubrir características de los nodos de la red.
Una de las funcionalidades que ofrece Pajek es el cálculo de la matriz geodésica. Esta matriz contiene todos los posibles caminos de distancia geodésica entre los nodos de la red. La distancia geodésica es “el número mínimo de pasos de un nodo a otro“.
La figura que encabeza este post (pulsando en la imagen se puede ver a tamaño real), visualiza la matriz geodésica que nos muestra la conectividad total entre todos los nodos y nos permite apreciar visualmente los nodos que más han favorecido la propagación de El meme de Enjut@ Mojamut@: Seccion Femenina, Colgado de las telecomunicaciones, Consultoria artesana en red, Carlos Garcia Argos , El albañil de Software, BarriBlog, El bloc de Carmen Pla, Opcion Web, Gamoia,
Pisito en Madrid, Diario de una profesional con niños, Tiscar.com, Freak s city, Hecho en Marbella y Eduardo Collado.
Alguno de los que han participado en este meme los estoy siguiendo en Twitter, como @tiscar, @fernand0,@carmepla, @petezin,@chiqui, @amfumero, @davidbs, @julen, @pisitoenmadrid,@ecollado,@ebrito, @emper, @labambola.
Es pequeñito el barrio y coincidimos en muchos sitios.
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Visualizando con Pajek el meme de Enjut@ Mojamut@
Publicado el 15-Agosto-2008
Este post documenta el uso de la herramienta Pajek para visualizar la propagación del meme de Enjut@ Mojamut@, por tanto continua a la saga: Exprimiendo el meme de Enjut@ Mojamut@, Juntos pero no revueltos y Visualizando con GraphViz el meme de Enjut@ Mojamut@.
El proyecto Pajek, traducción del slovenio ‘Araña’, fue creado en 1996 por Vladimir Batagelj y Andrej Mrvar de la Universidad de Ljubljana, Slovenia. El Software de Pajek funciona bajo la plataforma de Windows y es de libre distribución para uso no comerciales. Es una herramienta muy completa para los que estudian redes complejas, entre ellas las sociales. En este manual se describen todas sus posibilidades. Entre sus funciones está la de visualizar grafos, cuyas posibilidades se explicarán a lo largo de este post.
Pajek trabaja con un formato de entrada .net. No tiene definida la gramática formal, pero se se ajusta a esta notación BNF.
Para poder mostrar que la visualización no es algo complejo se utilizará el mismo método de explicación que en la herramienta GraphViz. mediante un procedimiento en tres pasos:
Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.
Transformar datos a formato .net: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato net.
Generar el gráfico: Se procesa el fichero .net con el programa Pajek
Al pulsar en las imágenes aparecerán en su tamaño real.
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Circular |
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Se han realizado tres visualizaciones en 2D, cada una con un layout distinto. El filtro awk aplicado y el fichero .net generado es el mismo para las los tres layouts:
- Filtro awk: memes_precedencias_pajek.awk
- fichero net generado: precedencias.net
- Comando para generar el fichero .net
Entorno de ejecución es Windows
| Es necesario bajarse el awk para Windows y el Pajek |
Pajek permite generar grafos en dos o tres dimensiones con distintos layouts y exportar a distintos formatos.
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Layout |
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Cicurlar
Layout generado automáticamente.
EigenValues Dibuja usando eigenvalues/eigenvectors (algoritmo de Lanczos). |
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Formatos de salida |
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| Imágenes en 2D | Imágenes en 3D
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Visualizando con Graphviz el meme de Enjut@ Mojamut@
Publicado el 9-Julio-2008
Este post es la continuación de la entrada “Juntos pero no revueltos” y aquí se publicarán algunas visualizaciones estáticas del meme de Enjut@ Mojamut@ y el proceso que he seguido para obtenerlas. El objetivo es mostrar que visualizar está al alcance de todos los que quieran ponerse a ello.
El pasado mes de marzo en un post titulado “Graphviz” se describió esta herramienta ilustrándola con varios ejemplos de visualización realizados por Gustavo Romero, estudiante de Telecomunicaciones en la Universidad Carlos III. Basándome en su experiencia (tuvo la amabilidad de pasarme sus fuentes) la he aplicado al meme de Enjut@ Mojamu@ haciendo algunos cambios en el tipo de herramienta de filtrado de datos. A continuación se describe el procedimiento en tres pasos:
Preparar datos de origen: Los datos del meme recogidos en una hoja de cálculo se salvan en formato texto separados por tabulaciones.
Transformar datos a formato dot: Se aplica un filtro awk al fichero de texto separado por tabulaciones y se genera un fichero en formato dot.
Generar el gráfico: Se procesa el fichero dot con el programa Graphviz.
Se han realizado tres visualizaciones que se presentan a continuación indicando el filtro awk aplicado, el fichero dot generado y el tipo de visualización elegida. En el post de Graphviz se explican los tipos de visualización de esta herramienta.
Al pulsar en las imágenes aparecerán en su tamaño real.
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Grafo libre: Esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme sin ninguna restricción.
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Grafo por nivel de propagación: esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme en la que se ha forzado a que los nodos se sitúen en su nivel de propagación.
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Grafo por tiempo de propagación: esta visualización corresponde al dibujo de la propagación del meme en la que se ha forzado a que los nodos se sitúen en su día publicación.
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Entornos de ejecución
| Linux | Utilizar el comando awk y bajarse el ejecutable para Graphviz para linux. |
| Windows | Bajarse el awk para Windows y el Graphviz para Windows |
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Acerca de este blog
Esta es la bitácora de M. Luz Congosto que he creado para recoger los avatares de esa aventura que se llama Doctorado. Soy una tesista en la Universidad Carlos III, intentando realizar una herramienta para descubrir barrios de blogs.
